Le Projet EuroMed Justice II constituera un Groupe de travail pour chacune des 3 composantes couvertes par le projet (Accès à la justice et aide légale; Résolution des conflits transfrontaliers en matière familiale; et Droit pénal et droit pénitentiaire). Ces groupes de travail seront composés de représentants de haut niveau et de professionnels de la justice des pays partenaires méditerranéens et des Etats membres de l’UE. Le but de chaque groupe de travail sera de réaliser une analyse approfondie de la situation et de rédiger des propositions concrètes sur les questions centrales de chaque groupe de travail. Plus concrètement, le produit final des travaux des groupes de travail devrait être un document d'orientation qui contiendrait : 

• une présentation de la situation dans chaque Partenaire méditerranéen ainsi que leur vision régionale. Une telle analyse impliquera aussi d’établir une ligne de base pour chacun des pays concernés sous l’angle du respect des standards internationaux en général et des standards européens en particulier dans les trois composantes couvertes par le programme.
• une analyse comparative soulignant les principes ou bases minima qui doivent inspirer les droits nationaux pour se mettre au diapason avec les standards internationaux reconnus. Cette analyse devrait tenir compte des traits caractéristiques des pays de la région.
• Un inventaire des propositions et recommandations spécifiques sur les aspects essentiels couverts par l’étude.